Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HPSEQ9Y251 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms