Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1AQ9Y241 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms