Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDAC5Q9UQL6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms