Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SHANK2Q9UPX8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK2Q9UPX8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms