Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX12Q9UMY4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms