Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZMYND8Q9ULU4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZMYND8Q9ULU4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms