Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHIC2Q9UKJ5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms