Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DKK4Q9UBT3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms