Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPS6KB2Q9UBS0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms