Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NLKQ9UBE8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms