Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
PHRF1Q9P1Y6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms