Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK12Q9NYV4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms