Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSD3Q9NYI0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSD3Q9NYI0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms