Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVK13-1Q9NX77 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms