Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHCHD3Q9NX63 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHCHD3Q9NX63 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms