Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DNAJC28Q9NX36 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms