Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms