Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HELLSQ9NRZ9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms