Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYTL1Q9NRR1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms