Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
BIN3Q9NQY0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms