Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FANCFQ9NPI8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FANCFQ9NPI8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FANCFQ9NPI8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FANCFQ9NPI8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FANCFQ9NPI8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FANCFQ9NPI8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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