Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE7BQ9NP56 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDE7BQ9NP56 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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