Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRMS1Q9HCU9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms