Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASSF4Q9H2L5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASSF4Q9H2L5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms