Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDCL3Q9H2J4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCL3Q9H2J4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms