Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms