Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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FOXQ1Q9C009 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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FOXQ1Q9C009 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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FOXQ1Q9C009 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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FOXQ1Q9C009 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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FOXQ1Q9C009 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXQ1Q9C009 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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