Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms