Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTRT3Q9BYD9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms