Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SALL3Q9BXA9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms