Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FNDC11Q9BVV2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms