Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBM42Q9BTD8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBM42Q9BTD8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms