Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTA3Q9BTC8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTA3Q9BTC8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms