Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK1Q9BRS2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms