Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLF1Q9BQI6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms