Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP9Q99956 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP9Q99956 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms