Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CRBNQ96SW2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms