Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SIN3AQ96ST3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIN3AQ96ST3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms