Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSRNP1Q96S65 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms