Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPS6KC1Q96S38 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms