Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGAP1Q96PV0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGAP1Q96PV0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms