Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1AQ96P16 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1AQ96P16 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1AQ96P16 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1AQ96P16 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1AQ96P16 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1AQ96P16 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1AQ96P16 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1AQ96P16 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1AQ96P16 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1AQ96P16 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1AQ96P16 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1AQ96P16 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1AQ96P16 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1AQ96P16 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1AQ96P16 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1AQ96P16 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1AQ96P16 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPRD1AQ96P16 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RPRD1AQ96P16 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPRD1AQ96P16 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms