Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF396Q96N95 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms