Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CFAP53Q96M91 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP53Q96M91 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms