Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms