Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PRAC1Q96KF2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms