Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
LRIG1Q96JA1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms