Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPD52L3Q96J77 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms