Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDC3Q96F86 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EDC3Q96F86 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDC3Q96F86 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDC3Q96F86 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDC3Q96F86 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDC3Q96F86 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDC3Q96F86 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDC3Q96F86 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDC3Q96F86 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDC3Q96F86 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDC3Q96F86 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDC3Q96F86 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDC3Q96F86 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDC3Q96F86 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDC3Q96F86 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDC3Q96F86 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDC3Q96F86 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDC3Q96F86 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDC3Q96F86 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDC3Q96F86 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDC3Q96F86 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDC3Q96F86 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDC3Q96F86 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms