Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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MRPL53Q96EL3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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MRPL53Q96EL3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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MRPL53Q96EL3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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